En los años de la colonia se destacan 4  figuras muy notables : el padre  Carlos Sigüenza y Góngora, Joaquín Velázquez de León , Antonio de León y Gama y el padre Antonio Alzate.

Carlos Sigüenza y Gongora nació en la ciudad de México en 1645. Como justo reconocimiento a sus méritos, fue nombrado, por el rey Carlos II, cosmógrafo real;  y el rey de Francia, Luis XIV, lo invitó a establecerse en París, cosa que no acepto. Por su parte, la universidad de México lo nombro profesor de matemáticas.
La determinación de la posición del cometa de 1680, valiéndose de un anteojo provisto de una retícula, y aplicando formulas de trigonometría esférica le merecieron elogios de Flamsteed. Del observatorio de Greenwich, y los de Cassini de París. Adelantándose a Halley, afirmó que los cometas son astros errantes. Murió en 1700.

Joaquín Velázquez de León, según Humboldt, fue el geómetra más notable después de Sígüenza. Nació en un pueblo del Estado de México, en 1725. Se dedicó a las matemáticas, a la física y a la astronomía. Observó en la Baja California, en 1769, el tránsito de Venus por el disco del sol; y la observación fue hecha tan cuidadosamente, que Cassini ordenó su publicación con sus notas relativas.
Era tanta la fama de que gozaba Velázques de León que M. La Chappe, jefe de la comisión francesa, y Vicente Dolz y Salvador de Medina, de la comisión Española, pidieron al astrónomo mexicano un informe de sus observaciones., Velázquez de León lo hizo en latín para la Francesa, y en español para la Española.
Su muerte, acaecida en 1786, se consideró como una gran pérdida para México.
El nombre de Joaquín Velázquez de León figura, con letras de oro, en el patio del edifico del antiguo Colegio de Minería, posteriormente escuela de ingenieros, por sus notables conocimientos en minerología y por su empeño en la fundación del citado colegio.

Antonio de León y Gama  fue contemporáneo de Velázquez de León y gran amigo suyo. Nació en la ciudad de México en 1735. Sin maestro, estudio las obras de Newton, Lalande y Bernoulli. En los ratos libres que le dejaban sus ocupaciones, observaba los eclipces de los satélites de Júpiter, las posiciones del Sol y de la Luna y de algunos planetas.
Observo el eclipse de Sol del 6 de noviembre de 1771, y con respecto a esto le escribía Lalande, el 6 de Mayo de 1773: " Veo con placer que México tiene en usted un sabio astrónomo... El eclipse me pareció haber sido calculado con mucha exactitud... Le ruego repita las observaciones de los satélites de Júpiter y me las envié. Yo le remitiré las mías..."
Calculó León y Gama en qué lugares celestes podría observarse el cometa de 1778. Dejo escrita una interesante disertación a propósito de una aurora boreal, visible en México en tiempo del Virrey Conde  de Revillagigedo. Falleció a los 67 años de edad, el 12 de septiembre de 1802.

José Antonio  Alzate, distinguido sacerdote y sabio  mexicano, nació en México en 1729. Aunque sus conocimientos fueron profundos en casi todas la ciencias, no fue precisamente un astrónomo. Sin embargo, dejó datos de sus observaciones acerca del paso o tránsito de Venus por el disco Solar, el 3 de Junio de 1769, y del eclipse de Luna del 12 de  Diciembre del mismo año . La academia de París nombro al  Padre Alzate su socio correspondiente. Falleció en 1791 a los 61 años de edad.